Ketika masa paganisme berlalu, ketika agama Kristen tidak lagi dianiaya dan diakui sebagai agama dunia, tampaknya semua perbedaan harus diselesaikan. Tetapi terkadang hanya Konsili Ekumenis yang dapat menyelesaikan konflik yang muncul, menolak ajaran sesat - bahkan tidak ada perdamaian di dalam Gereja.
Konsili Ekumenis pertama adalah Konsili Nicea, yang diadakan pada tahun 325. Alasan untuk ini adalah ajaran yang tersebar luas dari presbiter Aleksandria Arius. Esensinya adalah mengingkari identitas antara Allah Bapa dan Allah Anak. Dia berpendapat bahwa Yesus Kristus diciptakan oleh Tuhan, tetapi bukan inkarnasinya. Gagasan seperti itu pada dasarnya menyanggah semua dogma Kekristenan, dan oleh karena itu pada awalnya ajaran Arius ditolak oleh Dewan Lokal. Namun, presbiter yang bangga menolak untuk mengakui keputusan Dewan sebagai sah dan terus memenangkan hati umat beriman.
Kemudian Kaisar Konstantin mengundang para uskup dari seluruh dunia ke Dewan Ekumenis di kota kecil Nicea (sekarang disebut Iznik dan terletak di wilayah Turki modern). Beberapa perwakilan Gereja yang hadir memiliki bekas penyiksaan di tubuh mereka,diterima atas nama Kekristenan sejati. Uskup yang mendukung Arius juga hadir.
Debat berlangsung lebih dari dua bulan. Selama ini banyak terjadi diskusi, pidato para filosof, klarifikasi rumusan teologis. Seperti yang diceritakan legenda, manifestasi keajaiban ilahi mengakhiri pertengkaran itu. Sebagai kesatuan dari tiga prinsip, ia memberi contoh pecahan tanah liat: air, api, tanah liat memberikan satu kesatuan. Demikian juga, Tritunggal Mahakudus pada dasarnya adalah satu Allah. Setelah pidatonya, api muncul dari pecahan, air muncul dan tanah liat terbentuk. Setelah mukjizat seperti itu, Konsili Nicea akhirnya menolak ajaran palsu Arius, mengucilkannya dari Gereja, menyetujui Syahadat dan menetapkan 20 aturan disiplin gereja, menentukan tanggal perayaan Paskah.
Tetapi Dewan Gereja ini belum mengakhiri masalah ini. Kontroversi berlanjut untuk waktu yang sangat lama. Bahkan sekarang, gema mereka masih terdengar - Arianisme menjadi dasar dari ajaran Saksi-Saksi Yehuwa.
Selain Konsili 325, ada juga Konsili Nicea Kedua, yang diselenggarakan oleh Permaisuri Irene dari Konstantinopel pada tahun 787. Tujuannya adalah untuk menghapuskan ikonoklasme yang ada saat itu. Faktanya, Permaisuri membuat dua upaya untuk mengadakan Dewan Ekumenis. Tetapi pada tahun 786, para penjaga yang mendukung para ikonoklas menyerbu Kuil Para Rasul Suci di Konstantinopel, tempat Konsili mulai bekerja. Para ayah suci harus bubar.
Setelah menggunakan banyak trik, membubarkan penjaga lama, merekrut pasukan baru, Irina tetap mengadakan Katedral di787, tetapi memindahkannya dari Konstantinopel ke Nicea. Pekerjaannya berlangsung sebulan, mengikuti hasilnya, pemujaan ikon dipulihkan, mereka diizinkan di gereja.
Namun, bahkan Dewan Nicea ini gagal mencapai tujuannya sepenuhnya. Ikonoklasme terus ada. Gerakan ikonoklas akhirnya dikalahkan hanya pada tahun 843, di Konsili Konstantinopel.